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Fonctionnalités

Tout ce qui se passe entre l’instrument et la revue.

LabTools (ordinateur et iPhone) couvre tout le parcours d’un jeu de données : analyse et graphiques, assemblage des figures, manuscrit, et les dossiers du labo qui rendent le résultat reproductible. Un seul modèle de données en dessous, donc rien à exporter puis réimporter d’une étape à l’autre.

Télécharger gratuitementVoir les tutoriels

Sur cette page

  • Analyse et visualisation
  • Figures et manuscrits
  • Gestion du laboratoire
  • Collaboration
  • Automatisation et agents
  • Outils spécialisés
  • Plateforme et sécurité

Les éléments marqués en développement arriveront dans une version ultérieure et sont décrits tels qu’ils existent aujourd’hui.

Analyse et visualisation

Plus de 25 types de graphiques sur un seul moteur statistique

Chaque graphique repose sur le même modèle de données et les mêmes statistiques natives : le test effectué sur les données est celui affiché sur la figure.

Bibliothèque de graphiques de qualité publication

Histogrammes, boîtes à moustaches, violons, raincloud, swarm et strip plots, diagrammes en barres et en courbes, nuages de points 2D et 3D, cartes thermiques, volcano, Manhattan, ROC, Kaplan–Meier, Bland–Altman, dose-réponse, ACP et classification, forest plots et plus encore.

Moteur statistique natif

Plus de 70 fonctions compilées en code machine : statistiques descriptives, huit lois de probabilité, tests paramétriques et non paramétriques, tests de normalité et de variance, corrélations, tailles d’effet, analyse de puissance, survie, séries temporelles, modèles de mélange et détection des valeurs aberrantes.

Les statistiques sur la figure

Ajustements gaussiens et log-normaux, crochets de significativité avec correction des comparaisons multiples, bandes de confiance, droites de régression et marqueurs de quartiles sont tracés à partir de l’analyse, pas saisis à la main.

Comparaison de plusieurs jeux de données

Superposez autant de jeux de données que vous voulez, avec des axes indépendants, un style par série et des statistiques par groupe. Données au format long ou large, les deux sont comprises.

Traitement des données

Normalisation, lissage, correction de ligne de base, détection de pics, ajustement de courbes (Levenberg–Marquardt) et transformations Box–Cox / Yeo–Johnson, toutes enregistrées dans la configuration du graphique.

Des exports acceptés par les revues

SVG, PDF et PNG jusqu’à 1200 DPI avec polices intégrées, à la taille de l’écran ou sur mesure, et un fichier .labt qui conserve l’état complet du graphique pour le modifier plus tard.

28types de graphiques
70+fonctions statistiques
1200DPI en export matriciel
0allers-retours cloud pour un graphique

Figures et manuscrits

Du graphique à la figure puis au manuscrit, sans réexporter

Une figure fait référence aux graphiques qui la composent, et un manuscrit à ses figures. Modifiez l’analyse et tout ce qui en dépend se met à jour.

Assemblage de figures

Composez des figures à plusieurs panneaux sur une grille, avec lettres de panneaux automatiques, axes partagés ou indépendants, rapports de hauteur et de largeur, et une sortie au format de la revue, en pouces, au DPI voulu.

Éditeur de manuscrit

Rédigez l’article à côté des données. Insérez directement figures, posters et diaporamas, conservez les versions et travaillez avec vos coauteurs selon leur rôle.

Posters et présentations

Créez des posters de congrès et des diaporamas à partir des mêmes figures, avec des annotations et des mises en page qui restent liées aux graphiques d’origine.

Références et littérature

Cherchez dans PubMed, gérez une bibliothèque de références avec mots-clés et collections, joignez des PDF et notez quelles références chaque étude a utilisées.

Modèles et charte graphique

Enregistrez des styles pour une revue ou un labo et appliquez-les à n’importe quel graphique. Polices, quadrillage, axes, légendes et contours des classes suivent le modèle.

Traçabilité

Les graphiques sont enregistrés avec leur configuration et leur jeu de données source, les figures avec leurs panneaux, les manuscrits avec leurs figures. Le chemin du fichier brut au panneau publié est enregistré, pas laissé à la mémoire.

Gestion du laboratoire

Les dossiers qui rendent un résultat reproductible

Études, expériences, protocoles, entrées de cahier et tâches vivent à côté des données qu’ils décrivent, avec un journal d’activité en dessous.

Études et expériences

Organisez le travail en études (axes de recherche) contenant des expériences et des sous-expériences imbriquées, avec statut, priorité, prochaines étapes et synthèse. Marquez un travail comme en attente de quelqu’un et recevez des relances.

Protocoles versionnés

Chaque protocole garde son historique. Les études sont liées à une version précise et ne passent à la version actuelle que par un choix délibéré, jamais en silence.

Cahier de laboratoire

Entrées enrichies avec pièces jointes, mots-clés, liens de style wiki et rétroliens. Horodatées, consultables par recherche et rattachées à leur étude.

Tâches et calendrier

Des tâches avec statut, échéances et responsables sur un calendrier de labo partagé, plus un sondage de planification de réunions qui fonctionne depuis un lien.

Journal d’activité et synthèses

Observations, figures, graphiques et modifications de protocole s’inscrivent dans un journal par étude. Des synthèses hebdomadaires transforment ce journal en diaporama à présenter en réunion d’équipe.

Subventions et financementsen développement

Rédigez les sections d’une demande de subvention dans un éditeur structuré, exportez en Markdown et cherchez les appels NIH et NSF sans quitter l’application.

Collaboration

Conçu pour les groupes de recherche, pas adapté d’un logiciel de bureautique

Équipes et stockage partagé

Des espaces d’équipe avec accès selon les rôles. Stockage personnel, d’équipe et hors ligne dans une seule vue de fichiers de type Explorateur, avec onglets, vue partagée et glisser-déposer entre eux.

Une messagerie en contexte

Conversations en fils, partage de fichiers et mentions, à côté de l’étude dont on parle.

Appels vidéo

Appels vidéo et audio intégrés pour les réunions de labo et les collaborateurs à distance, avec partage d’écran, liens de réunion à envoyer par e-mail et invitations d’agenda.

Synchronisation cloud

Les fichiers se synchronisent vers un stockage compatible S3 avec détection des conflits. Épinglez des dossiers pour un usage hors ligne et continuez à travailler dans l’avion.

Un partage voulu

Invitez des collaborateurs sur un manuscrit ou une étude avec un rôle. L’accès suit l’invitation, et rien n’est partagé par accident.

Bench Remoteen développement

Pilotez l’application de bureau depuis un téléphone à la paillasse : lancez un minuteur de protocole, notez une observation, ajoutez une photo au cahier.

Automatisation et agents

Pilotez LabTools depuis un terminal ou depuis Claude

Chaque partie de l’application est accessible par une interface JSON-RPC locale et authentifiée. Un outil en ligne de commande et un serveur MCP s’appuient dessus.

CLI labtools

Importez des jeux de données, lancez des statistiques, créez et composez des graphiques, gérez études et fichiers depuis des scripts. Fonctionne sans interface pour les statistiques sur des tableaux bruts.

Serveur MCP pour agents IA

Claude et les autres agents compatibles MCP reçoivent chaque méthode enregistrée comme un outil : création de graphiques, tests statistiques, entrées de cahier, versions de protocoles, assemblage de figures, modifications du manuscrit.

Cellules de code

Un Code tab de type notebook, avec des cellules isolées qui appellent la même API, pour les analyses qui ont besoin d’une boucle.

Les mêmes pipelines font tourner le service Data Analysis

Outils spécialisés

Analyses propres aux instruments

Conçues avec les personnes qui utilisent les instruments, et décrites ici telles qu’elles existent aujourd’hui.

Microscopie à force atomique

Analyse des courbes force-distance avec détection du point de contact et modèles de Hertz, DMT et JKR. Forces de rupture des bicouches lipidiques supportées et alignement des cartes AFM-Raman.

Électrophorèse sur gel

Détection des pistes et des bandes, étalonnage des masses moléculaires et densitométrie à partir d’une image de gel.

Dynamique moléculaire

Analyse de trajectoires basée sur OpenMM : RMSD et RMSF, liaisons hydrogène, densité de liaison et bilans d’énergie libre, avec visualisation 3D des structures.

Liaison ADN-protéine

Analyse des sites de liaison et de l’occupation pour les données en molécule unique, avec des outils pour les enzymes de restriction et les oligonucléotides.

Dose-réponse et méta-analyse

Ajustement des EC50 et IC50 avec pentes de Hill ; forest plots à effets fixes et aléatoires avec statistiques d’hétérogénéité.

Cytométrie en flux, RMN, séquencesfeuille de route

Le fenêtrage (gating), le traitement spectral et les outils d’alignement sont sur la feuille de route et ne sont pas encore dans l’application publiée.

Plateforme et sécurité

Une application de bureau native qui garde vos données chez vous

Plateforme

  • Native, pas une page web. Tauri et Rust avec une interface React. Le moteur statistique est compilé à l’avance et s’exécute sur votre processeur.
  • Hors ligne d’abord. L’analyse, les graphiques, les cahiers et les études fonctionnent sans connexion. Le stockage cloud, les équipes et les appels en ont besoin.
  • Windows, macOS et Linux. Programme d’installation Windows 10/11 64 bits avec mises à jour signées, macOS sur Apple Silicon et Linux x86_64 en AppImage ou en .deb.
  • Importe les formats CSV, Excel et d’instruments ; exporte en SVG, PDF, PNG et dans son propre format .labt.
  • Passe à l’échelle d’une douzaine de lignes à des millions sans changer d’outil.

Sécurité

  • Connexion OAuth 2.0 / OpenID Connect avec des JWT validés à chaque requête.
  • Isolation au niveau des lignes dans la base de données : utilisateurs et équipes ne voient que leurs propres lignes.
  • TLS en transit pour chaque connexion, et des fichiers cloud limités à votre compte ou à votre équipe : l’application de bureau ne détient aucune clé de stockage, et le serveur vérifie votre compte avant toute lecture ou écriture de fichier.
  • Piste d’audit. Le journal d’activité enregistre qui a modifié quoi et quand.
  • Prévu : stockage conforme NIH/NSF, SOC 2 Type II, documentation GDPR.

TLS partout OAuth 2.0 + JWT Moteur en Rust hors ligne d’abord Plotly + statistiques natives

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Cette page a été traduite de l’anglais. L’application elle-même est en anglais.

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