Démo et tutoriels · 65 guides
Apprenez LabTools une figure à la fois.
Chaque tutoriel montre le résultat que vous allez obtenir, à côté d’une vidéo guidée. Parcourez-les par thème et par niveau, ou cherchez exactement ce qu’il vous faut.
Deux minutes : importer → tracer → mettre en forme → exporterCapture d’écran réelle
Se repérer dans LabTools
Une courte visite avant les vidéos d’analyse : le tableau de bord et sa liste Getting Started, le menu organisé par étape du travail, Ctrl+K pour aller n’importe où, le bouton + pour créer quelque chose depuis n’importe quelle page, et les guides qui vous accompagnent sur chaque page (? ou F1). Commentée, avec sous-titres.
Créer votre premier histogramme
Du tableau de bord à la figure finale : glissez un CSV de 600 hauteurs de particules dans Charts & Plots, choisissez Histogram et sélectionnez la colonne. Examinez les données brutes et le Statistics window, ajustez une gaussienne et vérifiez la qualité de l’ajustement, affichez n, la moyenne et le σ ajustés, la FWHM et le R² de l’ajustement sur le graphique, puis enregistrez-le dans LabTools. Commentée, avec sous-titres.
Télécharger les données d’exemple (particle-heights.csv)
Histogramme d’une distribution bimodale
Un échantillon qui mélange deux populations : ajustez deux composantes gaussiennes, lisez la moyenne, l’écart-type et le poids de chacune, et vérifiez la qualité de l’ajustement. Fixez délibérément la plage de l’axe des y, puis ajoutez au graphique les paramètres des composantes, la FWHM, le R² de l’ajustement et un test de normalité de Shapiro-Wilk. Commentée, avec sous-titres.
Télécharger les données d’exemple (bimodal-sizes.csv)
Histogramme d’une distribution multimodale
Laissez les données choisir le nombre de composantes : Suggest best compare des ajustements de une à dix composantes gaussiennes selon le BIC, le critère d’information bayésien, et marque le meilleur d’une étoile. Ajustez les trois composantes, puis affichez sur le graphique la moyenne, l’écart-type, la largeur et le poids de chacune, le R² de l’ajustement et un test de Shapiro-Wilk. Commentée, avec sous-titres.
Télécharger les données d’exemple (multimodal-sizes.csv)
Histogrammes superposés : comparer deux groupes
Témoin et traité sur un seul histogramme avec des classes communes : choisissez délibérément la largeur des classes, réglez l’opacité pour qu’aucun groupe ne masque l’autre, ajustez une gaussienne à chaque groupe et testez la différence sur la figure avec le test t de Welch et le d de Cohen. Commentée, avec sous-titres.
Télécharger les données d’exemple (particle-heights.csv)
Plusieurs histogrammes sur les mêmes axes
Une cinétique à trois points de temps en panneaux séparés qui partagent la plage des x et une même taille de classe choisie d’après les données, pour que chaque panneau compare ce qui est comparable. Ajustez tous les panneaux en un clic, donnez à chacun son propre encadré de statistiques et testez l’évolution dans le temps avec une ANOVA à un facteur et l’êta carré. Commentée, avec sous-titres.
Télécharger les données d’exemple (time-course.csv)
Comparer des groupes avec des boîtes à moustaches
Quatre groupes de traitement en boîtes à moustaches : ce que montrent la boîte, les moustaches et les valeurs aberrantes, chaque point de données tracé par-dessus les boîtes, et la comparaison des groupes sur la figure avec une ANOVA à un facteur, un test de Kruskal-Wallis et l’êta carré. Commentée, avec sous-titres.
Télécharger les données d’exemple (treatment-groups.csv)
Nuage de points avec régression
Un étalonnage dose-réponse : choisissez les colonnes x et y, ajoutez une régression linéaire avec son équation, son R² et sa bande de confiance, et indiquez sur le graphique les corrélations de Pearson et de Spearman. Commentée, avec sous-titres.
Télécharger les données d’exemple (dose-signal.csv)
Raincloud plots pour la distribution des données
Les quatre mêmes groupes en raincloud plot : le nuage de densité montre la forme de chaque distribution et la pluie montre chaque mesure. Le test de Shapiro-Wilk vérifie la normalité de chaque groupe, et le graphique indique à la fois l’ANOVA et le Kruskal-Wallis. Commentée, avec sous-titres.
Télécharger les données d’exemple (treatment-groups.csv)
Diagrammes en barres avec barres d’erreur
Les moyennes des groupes en barres avec barres d’erreur : l’erreur type de la moyenne face à l’écart-type, chaque point de données affiché sur les barres, et une ANOVA à un facteur avec l’êta carré sur la figure. Commentée, avec sous-titres.
Télécharger les données d’exemple (treatment-groups.csv)Créer une étude
Lancez une étude pour un axe de recherche ou un article : donnez-lui un titre, des notes et des mots-clés, choisissez si elle vous appartient ou appartient à l’équipe de votre labo, retrouvez-la par la recherche et découvrez les onglets où vivent ses expériences, son cahier, ses résultats, ses données et ses protocoles.
Les expériences d’une étude et leur statut
Ajoutez une expérience à une étude et gardez son statut honnête : en cours, en attente de quelqu’un d’autre (avec la date à laquelle vous attendez une réponse), bloquée ou en pause, et voyez-les toutes d’un coup d’œil sur la page de l’étude.
Prochaines étapes, sous-expériences et synthèse
Planifiez à l’intérieur d’une expérience : des prochaines étapes avec échéances, des sous-expériences pour chaque partie du travail, la chronologie, et une synthèse en diapositives construite à partir de ses instantanés, qui peut aussi arriver chaque semaine.
Des protocoles avec leurs versions
Rédigez un protocole, liez-le à une étude, enregistrez une nouvelle version quand la méthode change et passez l’étude à la version actuelle, tandis que l’ancienne reste archivée.
Le cahier de laboratoire
Tenez un journal quotidien et des entrées d’expérience liées à une étude : des [[liens]] entre entrées, un graphique inséré depuis Charts & Plots, des modèles pour le travail répétitif et des rétroliens qui montrent où une entrée est utilisée.
Calendrier et tâches
Consultez le planning du labo, ajoutez une tâche avec une échéance et un événement, et cochez les tâches terminées au fil du travail.
Le bilan hebdomadaire
Revenez sur la semaine : ce qui a été fait, ce qui a pris du retard et les personnes dont vous attendez une réponse, relancez celles dont vous avez besoin et planifiez la semaine suivante.
Réunions : sondages, invitations et liens de connexion
Trouvez un créneau avec un sondage, planifiez directement une réunion, invitez des personnes par e-mail et rejoignez-la depuis le lien de la réunion ou le rappel.
Recherche bibliographique
Cherchez dans PubMed et CrossRef, lisez un résumé, enregistrez un article dans votre bibliothèque, classez-le dans une étude et copiez une citation mise en forme.
Des articles au forest plot
Une petite méta-analyse : rassemblez les articles, extrayez chaque taille d’effet et son intervalle de confiance, et présentez-les dans un forest plot avec l’estimation combinée.
Le Reference Manager
Ajoutez une référence par son DOI, importez un fichier BibTeX, organisez vos références avec des mots-clés et citez-les dans vos textes.
Lire un article dans le PDF Reader
Ouvrez un article, faites-y une recherche, surlignez et ajoutez des notes, accédez à ses références et figures, et gardez vos annotations avec l’article.
Fichiers : stocker, organiser et prévisualiser les données
Conservez les données brutes dans LabTools Files, organisées par étude, prévisualisez un fichier sans le télécharger et ouvrez-le dans Charts & Plots en un clic.
Fichiers : versions, corbeille et recherche dans les fichiers
Revenez à une version antérieure d’un fichier, restaurez depuis la corbeille ce que vous avez supprimé, et trouvez des fichiers d’après leur contenu, comme un nom de colonne ou un réglage d’instrument.
Tableur : une courbe d’étalonnage, de la saisie au graphique
Saisissez des mesures répétées, calculez moyennes et écarts-types avec des formules, enregistrez la feuille dans LabTools et envoyez les colonnes vers Charts & Plots pour une régression avec ses statistiques sur le graphique.
Code : la même analyse, écrite et reproductible
Lancez un test statistique et une série de graphiques depuis le notebook Code sur un jeu de données ouvert, rassemblez les résultats dans une figure et enregistrez le notebook pour le relancer sur le jeu de données suivant.
Tampons et dilutions en série
Préparez un tampon phosphate à partir de solutions mères, avec le rapport de Henderson-Hasselbalch expliqué, puis planifiez une série de dilutions au dixième pour une courbe d’étalonnage.
PCR et quantification de l’ADN
Planifiez un mélange réactionnel (master mix) et un programme de cycles PCR, puis quantifiez le produit purifié par son absorbance à 260 nm et enregistrez le résultat dans l’étude.
Gel Analyzer : pistes, bandes et tailles
Détectez les pistes et les bandes d’une image de gel, déterminez la taille des bandes par rapport au marqueur, vérifiez-les sur l’image et quantifiez l’intensité des bandes.
Spectres Raman
Nettoyez deux spectres Raman par lissage, correction de ligne de base et normalisation, trouvez et identifiez les pics, et comparez les échantillons.
Cartes de force AFM : module de Young
Ajustez le module de Young sur chaque courbe de deux cartes de force, vérifiez les courbes rejetées et les ajustements, comparez les cartes, présentez la distribution avec ses statistiques et enregistrez le tout dans l’étude.
AFM : force de rupture d’une bicouche lipidique
Trouvez l’événement de rupture sur chaque courbe de force, examinez les courbes et lisez la force de rupture et l’épaisseur de la bicouche.
AFM-Raman Mapper
Ouvrez une mesure combinée AFM et Raman, repérez une bande sur la carte Raman et lisez le spectre au niveau d’un élément de la topographie.
D’un graphique à une figure, une diapositive ou un manuscrit
Envoyez un graphique terminé plus loin : dans une figure, une présentation, un poster, un manuscrit ou le cahier, et il reste modifiable où qu’il aille.
Construire une figure de publication
Combinez des graphiques enregistrés et une image en une seule figure à plusieurs panneaux, au format de la revue, avec des lettres de panneaux, et gardez-la modifiable.
Présentations : le diaporama de la réunion d’équipe hebdomadaire
Créez en une étape un diaporama de réunion d’équipe à partir des nouveaux résultats d’une étude, modifiez-le dans le Presentation Builder et enregistrez-le dans LabTools ou au format PowerPoint.
Posters de congrès
Transformez une figure en poster de congrès A0 avec des sections, un titre et un QR code, et vérifiez-le avant l’impression.
Rédiger un manuscrit
Commencez un article de recherche à partir d’un modèle, insérez une figure avec sa légende, citez des références et rédigez-le avec vos coauteurs.
Image Converter
Convertissez en une étape une série d’images de microscope en TIFF sans perte, dans un seul dossier.
Cartes de plasmides et schémas d’ADN
Dessinez une carte de plasmide avec ses sites de restriction uniques et ses éléments, prête pour une figure.
Oligonucleotide Builder
Vérifiez qu’une paire d’amorces ne forme ni dimères ni épingles à cheveux, puis simulez un assemblage d’oligos à extrémités cohésives et obtenez son protocole de paillasse.
Équipes : votre groupe de recherche dans LabTools
Créez une équipe pour votre labo, attribuez-lui du stockage, ajoutez des membres avec un rôle et un titre, et voyez où se trouvent les fichiers et études partagés de l’équipe.
Lancer une collaboration avec un autre labo
Créez une collaboration, invitez des personnes d’autres labos avec un rôle, ou lancez-en une directement depuis une étude.
Travailler dans une collaboration : actualités, fichiers et messagerie
Le travail quotidien d’une collaboration : lisez et publiez des actualités de recherche, commentez-les, partagez des fichiers et échangez dans la messagerie de la collaboration.
Trouver des collaborateurs
Cherchez des chercheurs et des labos par compétence ou par centre d’intérêt, lisez un profil et prenez contact.
Messages et partage de fichiers
Conversations directes et d’équipe, et partage d’un fichier dans la messagerie dans la version exacte voulue, avec une date d’expiration et des options de téléchargement.
Appels et partage d’écran
Lancez un appel vidéo depuis une conversation, partagez votre écran pour présenter un résultat, puis terminez l’appel.
L’essentiel du compte et des paramètres
Votre profil, l’espace de stockage utilisé et les options d’aide et d’astuces (Help et Tips).
Aide et guides : laissez LabTools vous montrer
Comment fonctionnent les guides intégrés : le bouton ? (F1) liste les guides de la page où vous êtes, et un guide vous fait parcourir les vraies commandes pas à pas.
Importer des fichiers CSV et Excel
Importez des fichiers CSV, TSV, texte et Excel : ce que LabTools détecte (colonnes, formats de nombres y compris la virgule décimale, encodages de texte) et le message clair qui s’affiche quand un fichier ne peut pas être lu.
Réaliser un test t pour échantillons indépendants
Comparez deux groupes : vérifiez d’abord la normalité et l’égalité des variances, choisissez le test t de Student ou de Welch, et rapportez la valeur p avec une taille d’effet et son intervalle de confiance.
Test t apparié pour les études avant/après
Analysez des mesures appariées sur les mêmes échantillons avant et après un traitement : le test t apparié, le test des rangs signés de Wilcoxon quand les différences ne sont pas normales, et la taille d’effet.
ANOVA à un facteur avec comparaisons par paires
Comparez trois groupes ou plus avec une ANOVA à un facteur ou une ANOVA de Welch, poursuivez avec des comparaisons par paires ajustées pour les tests multiples et affichez le résultat sur le graphique.
Résumé des statistiques descriptives
Le Statistics window d’un jeu de données : moyenne, médiane, écart-type, erreur type de la moyenne, intervalles de confiance, asymétrie, aplatissement, tests de normalité et valeurs aberrantes, et lesquels ont leur place sur la figure.
Courbes dose-réponse et IC50
Ajustez une courbe logistique à quatre paramètres à une série de dilutions, lisez l’IC50 ou l’EC50 avec son intervalle de confiance et la pente de Hill, et placez l’ajustement sur la figure.
Violin plots et strip plots
Montrez la forme complète de chaque groupe avec des violin plots, ou chaque mesure avec un strip plot ou un swarm plot, et choisissez celui qui convient à vos données.
Courbes de survie de Kaplan-Meier
Tracez la survie au cours du temps pour deux groupes ou plus, avec les observations censurées marquées, et comparez les courbes.
Volcano plots pour les résultats différentiels
Tracez le facteur de variation en fonction de la significativité pour des milliers de gènes ou de protéines, fixez les seuils et annotez les résultats marquants.
Bland-Altman : comparer deux méthodes
Vérifiez si deux méthodes de mesure concordent : la différence moyenne (biais) et les limites d’agrément, et pourquoi une corrélation ne suffit pas.
Courbes ROC pour un test diagnostique
Tracez la sensibilité en fonction de 1 - spécificité, lisez l’aire sous la courbe et choisissez un seuil.
ACP et classification
Réduisez de nombreuses variables mesurées à leurs composantes principales, voyez comment les échantillons se regroupent et comparez avec une classification des mêmes données.
Courbes pour les cinétiques
Tracez une mesure au cours du temps pour plusieurs conditions, avec barres ou bandes d’erreur, et gardez des axes comparables d’une expérience à l’autre.
Exporter des figures pour les revues
Exportez un graphique à la taille demandée par une revue (Nature, Cell, Science, PLOS et d’autres) en PNG, SVG ou PDF, et vérifiez que le plus petit texte et les traits les plus fins respectent les minimums de la revue.
Enregistrer et réutiliser des styles de graphiques
Gardez une charte graphique pour tous vos graphiques : polices, couleurs et axes, enregistrés une fois et appliqués à la figure suivante.
Raccourcis clavier et astuces
Ctrl+K pour aller n’importe où, Ctrl+S pour enregistrer, et les raccourcis qui accélèrent la modification des graphiques et la navigation.
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Prêt à essayer vous-même ?
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